Non, vous ne pouvez enregistrer qu’un ID de Synchro-Jeu par version sur un compte au Club des Dresseurs Pokémon. Par exemple, vous pouvez enregistrer un ID de Synchro-Jeu pour Pokémon Soleil, et un autre pour Pokémon Ultra-Lune, mais pas pour deux exemplaires de Pokémon Ultra-Lune.
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